秘境首领需达到伙伴评分要求才能进入对应场景，且从高到低仅限前6只可进入，属于16大跨服模式。场景有归属、抢夺、中立三种模式，进入默认中立模式，对首领造成首刀的玩家自动变为归属模式，争夺时可进入抢夺模式，远离首领或被击杀会失去归属并切回中立模式。秘境首领血量少于10%时会触发20秒无敌护盾。
击败秘境首领有不少珍稀掉落。1级可用的随机背饰宝箱，击杀首领小概率掉落凤凰披风、百花披风、孔雀披风等背饰；20级可用的檀香仙子伙伴，能激活和升星其伙伴幻化，增加生命、攻击等属性；330级可用的伙伴觉醒丹，在伙伴-觉醒界面使用，伙伴觉醒可获得大量属性，添加金色药水还能大幅提高成功率，觉醒到特定等级会激活觉醒技。